Ömer Erdoğan, 3 Mayıs 1977 tarihinde Almanya’nın Kassel kentinde dünyaya geldi. Futbola Almanya’da başladı. Babası altı-yedi yaşlarında bir altyapı kadrosuna gönderdi. Daima antrenmanlara, maçlara götürdü. Futbolcu olmasında büyük katkısı vardı. 17 yaşında profesyonel oldu.
18 yaşında Hamburg kentinin bir ekibi olan St. Pauli’ye transfer oldu. 1998-99 döneminde teknik yönetici Hikmet Karaman’ın isteğiyle Erzurumspor’a transfer oldu. Burada iki dönem misyon aldıktan sonra kadrodan ayrıldı. 2001-02 döneminde Diyarbakırspor’a transfer oldu ve iki dönem forma giydikten sonra Galatasaray’a transfer oldu.
Galatasaray
2002-03 döneminde Fatih Terim tarafından büyük umutlarla Galatasaray’a transfer edildi. Fatih Terim’in Galatasaray’a kaptanı Bülent Korkmaz ve Barcelona’dan yeni transfer Frank de Boer’i tercih etmesi nedeniyle daha çok yedek kaldı. Birinci yarıda birkaç maçta sonradan oyuna girdi. İkinci yarıda Galatasaray ekibinde gençleştirme operasyonu olunca birtakım futbolcular takım dışı kaldı ve Ömer tertipli olarak forma talihi buldu. Ama Galatasaray’da Terim’in istifası ile misyona gelen teknik yöneticiliğe Hagi, eski futbolcular affetti ve Ömer tekrar yedeğe düştü. Dönem sonunda da ekipten ayrıldı.
Malatyaspor
Galatasaray’dan Malatyaspor’a transfer oldu ve iki dönem forma giydi. Malatyaspor’da son maçlarda dört gol atarak dikkat çekti ve birçok kulübün dikkatini çekti.
Bursaspor
2006-07 dönemi öncesinde Bursaspor’a transfer oldu. Oyunuyla herkesin takdirini kazanan başarılı oyuncu, Bursaspor’da kaptanlığa kadar yükseldi, A ulusal gruba seçildi. 13.05.2013 tarihinde Bursa’da oynanan Bursaspor-Eskişehirspor maçı ile etkin futbol yaşantısına son vererek futbolu Bursaspor’da bıraktı.
Ulusal Grup Mesleği
Birinci kere 30 Nisan 2003 tarihinde Türkiye A2 ile Almanya’ya karşı giydiği maçta ulusal oldu.
Türkiye A kadroya birinci kere 27 Ağustos 2010 tarihinde aday takıma çağrıldı.
Antrenörlük mesleği
Ömer Erdoğan futbolculuğu bırakmasının akabinde 2013 yılında antrenör oldu ve Ertuğrul Sağlam’ın Eskişehirspor’un başına geçmesiyle bu grupta yardımcı antrenörlük misyonunu üstlendi.